Ricerca e cura

Giaguaro

23 Settembre 2026

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Un nuovo assemblaggio del genoma del giaguaro (Panthera onca) fornisce un riferimento genomico più completo per studiare la specie e supportarne la conservazione. Il risultato arriva da uno studio internazionale pubblicato su BMC Genomic Data, che ha ottenuto un assemblaggio a livello cromosomico con il 99,85% della sequenza assegnata ai cromosomi e 25.267 geni codificanti proteine annotati. 

Il giaguaro è un grande felide originario delle Americhe. Le sue popolazioni hanno registrato una riduzione associata alla perdita dell'habitat. Secondo gli autori, la disponibilità di un genoma di riferimento di elevata qualità può contribuire sia allo studio della biologia e dell'evoluzione della specie sia alle attività di monitoraggio e conservazione. Un'annotazione più completa permette inoltre di contestualizzare meglio le varianti genetiche rilevate nelle diverse popolazioni. 

Per realizzare il nuovo riferimento, denominato mPanOnc3.5, i ricercatori hanno utilizzato materiale proveniente da due giaguari in cattività ospitati nell'ex zoo di Buenos Aires, oggi Eco-Park: un maschio, Tango, e una femmina, Gorda. Sono state impiegate tecnologie di sequenziamento a letture lunghe Oxford Nanopore e a letture corte Illumina, integrate con dati Hi-C già disponibili pubblicamente. 

L'assemblaggio ottenuto presenta 19 super-scaffold corrispondenti ai 18 autosomi e al cromosoma X, in linea con il cariotipo noto del giaguaro. Rispetto al precedente assemblaggio annotato a livello cromosomico, pubblicato dal progetto DNA Zoo, il nuovo riferimento presenta una maggiore continuità, con un contig N50 pari a 48,04 Mb. 

Il nuovo genoma si inserisce in un percorso di ricerca avviato con la prima sequenza genomica del giaguaro pubblicata nel 2017. Quel riferimento è stato utilizzato, tra l'altro, per studi di genomica delle popolazioni e per analizzare adattamenti evolutivi. Secondo gli autori, la sua limitata continuità rendeva però necessario un ulteriore miglioramento del riferimento disponibile. 

Il nuovo assemblaggio presenta alcuni limiti indicati dagli stessi ricercatori. Non comprende il cromosoma Y e non consente di risolvere completamente il genoma nei due aplotipi. Inoltre, parte dei dati utilizzati per la correzione della sequenza proviene da un individuo diverso. Gli autori precisano tuttavia che questo aspetto non dovrebbe compromettere l'identificazione delle varianti nelle popolazioni attraverso l'allineamento al genoma di riferimento. 

Secondo i ricercatori, la maggiore qualità dell'assemblaggio mette ora a disposizione uno strumento per approfondire la genomica del giaguaro e può contribuire alla definizione di strategie più appropriate di conservazione e reintroduzione della specie. I dati di sequenziamento e l'assemblaggio sono stati resi disponibili in archivi pubblici. 

 BMC Genomic Data