Genetica

lagomorfi

24 Giugno 2022

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Il virus dell'epatite E (HEV), è la principale causa di epatite virale acuta in tutto il mondo, e di solito provoca infezioni autolimitanti in individui comuni. Tuttavia, può portare a infezioni croniche in organismi immunocompromessi e i suoi meccanismi rimangono poco chiari. Nei conigli, ospiti naturali dell'HEV, sono state osservate infezioni croniche da HEV. Questo ha portato i ricercatori a studiare i potenziali geni chiave nel processo di cronicità dell'HEV nei conigli. Dal punto di vista metodologico, lo studio si è avvalso sia di analisi bioinformatiche che di analisi sperimentali.  

Lo studio

Le analisi hanno portato all’individuazione di 94 geni differenzialmente espressi (DEG) e di 10 geni hub, ovvero geni cruciali che hanno interazioni con altri geni nelle reti geniche. Successivamente si sono divisi i conigli in due gruppi: il gruppo P, i cui componenti (4) mostravano sintomi di infezione cronica da HEV e il gruppo N, composta da 6 esemplari HEV negativi. Si è poi proceduto a un confronto tra le due coorti, rilevando i geni hub identificati nei gruppi P e N mediante PCR. E’ risultato che le espressioni di MX1, OAS2 e IFI44 erano significativamente più elevate nel gruppo P (P  <0, 05). Se ne è concluso che, visti i valori significativamente più elevati tra i conigli positivi,  MX1, OAS2 e IFI44 potrebbero essere coinvolti nella patogenesi della cronicità di HEV e potrebbero quindi svolgere – se l’ipotesi trovasse conferma – il ruolo biomarcatori nella cronicità dell'infezione.

Li, M., Wang, Y., Li, K. et al. Characterization of highly expressed novel hub genes in hepatitis E virus chronicity in rabbits: a bioinformatics and experimental analysis. BMC Vet Res 18, 239 (2022). https://doi.org/10.1186/s12917-022-03337-x

TAG: BIOMARCATORI, CONIGLI, EPATITE CRONICA, GENI HUB